1. 万花谷

    门派诗：春兰秋菊夏清风，三星望月挂夜空。不求独避风雨外，只笑桃源非梦中。

    简介：万花谷是一处隐世桃源，坐落于群山之中，需要穿过一条秘密隧道才能到达。谷主东方宇轩游历到此，惊叹于谷中四季如春，终年繁花似锦，与世隔绝，恍若仙境。遂居隐于此，招纳贤士，并命名为万花谷。谷中奇人隐士云集，谷中弟子需修习七艺：琴棋书画医茶工，而其中医术之精湛是最为江湖所知的。万花谷不是家族门派，多由散人组成。

2. 少林寺

    简介：少林寺是现实历史中存在的机构，游戏中的少林寺以其深厚的武学底蕴和禅宗思想为背景，弟子们修习少林七十二绝技，以禅入武，以武修禅。

3. 纯阳宫

    简介：纯阳宫的祖师是吕洞宾，历史人物，“纯阳子”就是吕洞宾的号。纯阳宫的弟子修习剑法和气功，分为剑纯和气纯两种心法，前者以剑术为主，后者以内功和气场控制为主。

4. 七秀坊

    简介：七秀坊由历史人物公孙大娘创立，是大唐三大风雅之地之一。七秀坊只收孤儿，以剑舞闻名，技能名称多来源于杜甫的《观公孙大娘弟子舞剑器行》。

5. 天策府

    简介：天策府是现实历史中存在的机构，游戏中的天策府以骑兵和枪术著称，是大唐的精锐部队，弟子们以忠诚和勇猛闻名。

6. 藏剑山庄

    简介：藏剑山庄出场在剑侠系列其他单机游戏中，早于剑三问世，所以这不属于原创。藏剑山庄以铸剑和剑术闻名，弟子们追求剑道的*。

7. 五毒教

    简介：五毒教最早出现在金庸武侠小说《碧血剑》中，以后各类游戏、影视、小说皆借用这个名字，但内容都各不相同。五毒教以使用毒术和蛊术著称，弟子们与自然和毒物有着密切的联系。

8. 唐门

    简介：唐门最早由作家白羽创造，之后这两个字就流传下来了，以至于很多作品都借鉴。唐门以暗器和机关术闻名，弟子们擅长远程攻击和潜行。

9. 明教

    简介：明教又称摩尼教，现实中存在的宗教。最出名的乃是金庸武侠小说《倚天屠龙记》中的描写。明教以火焰和光明为象征，弟子们信仰坚定，武学独特。

10. 丐帮

     门派诗：黄泉作酒酬兄弟，战尽狂沙血未干。

     简介：丐帮由尹天赐所建，总舵位于洞庭湖君山岛，以“忠义”为*帮规，是个锄强扶弱，信守承诺，立于正道的门派。丐帮武学以“降龙十八掌”与“打狗棒法”闻名天下。